L’elemento più interessante della basilica è la Cappella Bolognini, posta a circa metà della navata sinistra, uno delle principali opere tardo-gotiche italiane.
L’intera cappella fu affrescata agli albori del Quattrocento da Giovanni da Modena, pittore protagonista di una recente riscoperta da parte degli studiosi, capace di fondere l’interesse per il dettagli minuti e curiosi, realizzati con particolare interesse naturalistico, tipico delle francesizzanti corti del nord Italia del periodo, al forte senso plastico, realistico e a tratti caricaturali delle figure.
Gli affreschi della cappella riguardano le Storie dei Re Magi, nella parete sinistra e centrale, e il Giudizio universale, in quella di destra, dove trova posto un’immaginifica visione dell’Inferno, col gigantesco e nero Satana insaziabile divoratore delle anime dannate.
A completare la Cappella vi è il grande polittico ligneo, opera di Jacopo di Paolo, e la transenna marmorea progettata da Antonio di Vincenzo.